Instytut Genetyki Roślin
Polskiej Akademii Nauk

Laboratorium Multiomiki

Kierownik       
dr Katarzyna Juszczyk
 

Laboratorium zostało utworzone w celu prowadzenia prac analitycznych nad niskocząsteczkowymi i białkowymi komponentami organizmów roślin. Współpracuje ono z różnymi Zakładami Instytutu jak również z innymi krajowymi i zagranicznymi placówkami naukowymi. Na wyposażeniu Laboratorium są chromatograf gazowy, instrumenty do wysoko- oraz ultrasprawnej chromatografii cieczowej oraz spektrometry mas. Dzięki możliwości połączenia standardowych i nanoprzepływowych chromatografów cieczowych z wysokorozdzielczym spektrometrem mas OrbiTrap prowadzone są niecelowane i celowane analizy metabolomiczne i proteomiczne.

Laboratorium Multiomiki oferuje szeroki zakres analiz :

  • Oznaczanie jakościowe i ilościowe alkaloidów w łubinach – GC-FID
  • Metabolomika: analiza metabolitów pierwotnych (aminokwasy, nukleotydy, cukry, lipidy) i wtórnych (fenole i polifenole, fenylopropanoidy, flawonoidy, terpeny i terpenoidy, alkaloidy) u roślin
    • Analiza metabolitów o aktywności biologicznej roślin uprawnych i leczniczych
    • Analiza metabolitów grzybów (m.in. mykotoksyn)
  • Lipidomika: rozdzielanie i identyfikacja lipidów i związków pochodnych
  • Proteomika: rozdzielanie i identyfikacja białek i peptydów
  • Analiza spektrometryczna (wartość m/z i widmo fragmentacyjne) pojedynczych związków lub frakcji z zastosowaniem źródła nanoESI z wbudowanym autosamplerem

Laboratorium dysponuje następującym wyposażeniem:

  • Wysokorozdzielczy spektrometr masowy OrbiTrap (QExactive, Thermo) wyposażony w źródła jonów HESI-II i nanoESI
  • Nanoprzepływowy chromatograf cieczowy (RSLC nano Ultimate 3000, Dionex, Thermo)
  • Ultrawysokosprawny chromatograf cieczowy z detektorem PDA (UPLC-PDA, ACQUITY, Waters)
  • Wysokosprawny chromatograf cieczowy (HPLC 1100, Agilent) z pułapką jonową (IT-MS, Esquire 3000, Bruker)
  • Źródło jonów nanoESI z wbudowanym autosamplerem i kolektorem frakcji (TriVersa NanoMate, Advion)
  • Chromatograf gazowy z detektorem FID (GC-2014 Shimadzu)

Copyright Instytut Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk