Notice: Undefined index: alias in /home/people/clients/igrpan/igrwww/www_prod/modules/MleCMS/MleCMS.module.php on line 302
Zespół Regulacji Ekspresji Genów

Zespół Regulacji Ekspresji Genów

Lider

       dr Agnieszka Kiełbowicz-Matuk

Skład

prof. Tadeusz Rorat - prof. emeryt.
mgr inż. Magdalena Biegańska
mgr inż. Jagoda Czarnecka (doktorantka)
mgr inż. Urszula Talar (doktorantka)

Obiektem badań Zespołu są dwa gatunki z rodzaju Solanum, gatunek uprawny S. tuberosum i gatunek dziki S. sogarandinum, różniące się tolerancją na zamarzanie i zdolnością do aklimatyzacji do niskich temperatur, a także dziewięć genotypów w obrębie gatunku Hordeum vulgare różniących się tolerancją na niedobór wody.

Profil badawczy

  • Molekularne podstawy tolerancji roślin na stresy abiotyczne (niska temperatura, susza, zasolenie).
  • Izolacja i identyfikacja genów, których aktywność prowadzi do aklimatyzacji roślin do niskiej temperatury oraz adaptacji do warunków suszy glebowej.
  • Identyfikacja genów, których ekspresja jest związana z utrzymaniem parametrów plonu w warunkach stresowych.
  • Analiza funkcji białkowych produktów ekspresji wyizolowanych genów w rozwoju oraz aklimatyzacji do warunków stresowych.

Metody

  • uprawa roślin w warunkach in vitro i in vivo w fitotronie,
  • testy tolerancji roślin na niską temperaturę i suszę w warunkach symulowanych,
  • analizy fizjologiczne (RWC, wyciek elektrolitów, parametry wymiany gazowej),
  • analiza ekspresji genów na poziomie transkrypcyjnym (RT-PCR, Northern blot) oraz kodowanego białka (Western blot),
  • izolacja czynników transkrypcyjnych wiążących się do sekwencji cis regulatorowych obecnych w rejonach promotorowych genów (drożdżowy system jednohybrydowy, Y1H; test przesunięcia mobilności elektroforetycznej, EMSA),
  • badanie oddziaływań białko-białko (immunoprecypitacja, koimmunoprecypitacja; drożdżowy system dwuhybrydowy, Y2H). 

Obecnie prowadzone prace badawcze

Jednym z głównych kierunków badań prowadzonych obecnie w Zespole są prace związane z  poznaniem mechanizmów regulacji ekspresji genu SsBBX24 kodującego białko zawierające domeny palca cynkowego typu B-box w cyklu okołodobowym w rozwoju oraz w warunkach prowadzących do dehydratacji komórek u gatunków Solanum. Główne aspekty badań obejmują: (i)  identyfikację czynników transkrypcyjnych, które regulują ekspresję genu SsBBX24 podczas rytmu okołodobowego w warunkach normalnych i stresowych przy zastosowaniu drożdżowego systemu jednohybrydowego i techniki EMSA; (ii) identyfikację białka lub kompleksów białkowych, które oddziałują z białkiem SsBBX24 w warunkach normalnych i stresowych w różnych fazach rytmu okołodobowego za pomocą techniki koimmunoprecypitacji i drożdżowego systemu dwuhybrydowego.

Wybrane publikacje

Projekty badawcze

  • Nr projektu:  2014/15/B/NZ9/04809
    Tytuł projektu:Analiza funkcjonalna białka SsBX24 zawierającego domeny wiążące cynk w cyklu okołodobowym podczas rozwoju i odpowiedzi na zasolenie
    Typ: OPUS
    Kierownik projektu: T. Rorat/ A. Kiełbowicz-Matuk
    Okres realizacji:  20 lipca 2015 - 19 lipca 2018