Notice: Undefined index: alias in /home/people/clients/igrpan/igrwww/www_prod/modules/MleCMS/MleCMS.module.php on line 302
Zespół Fitopatologii Molekularnej
Na skróty

Zespół Fitopatologii Molekularnej

Lider

prof. dr hab. Małgorzata Jędryczka

Skład

dr Joanna Kaczmarek
mgr inż. Witold Irzykowski
mgr inż. Paweł Serbiak (doktorant)
Romana Wawrzyniak
Magdalena Wlaszczyk

Celem badań jest opracowanie metod wczesnej detekcji grzybów chorobotwórczych wobec roślin uprawnych w powietrzu i w tkankach roślin-gospodarzy w celu identyfikacji patogenów i wspomagania strategii ich zwalczania. Od 2004 roku Zespół prowadzi system wspierania decyzji SPEC (www.spec.edu.pl) - trzeci pod względem wielkości na świecie system monitoringu aerobiologicznego inokulum pierwotnego patogenów roślin uprawnych. Badania dotyczą także mikologicznej i molekularnej charakterystyki patogenów w celu poznania struktury oraz śledzenia zmian w ich populacjach, dla prawidłowego wyznaczania strategii hodowli odpornościowej. W badanym materiale roślinnym poszukujemy źródeł genetycznej odporności na patogeny. Badania nad etiologią i epidemiologią dotyczą chorób powodowanych przez patogeny z królestwa grzybów (Fungi), w tym grzyby nekrotroficzne (głównie z rodzajów: Alternaria, Fusarium, Leptosphaeria, Ramularia i Sclerotinia), jak też biotroficzne (Melampsora). Obecnie badaniami objęto także Plasmodiophora brassicae - przedstawiciela pierwotniaków (Protista).

Profil badawczy

  • Izolacja i identyfikacja mikologiczna i molekularna grzybów chorobotwórczych wobec roślin uprawnych.
  • Identyfikacja genów awirulencji i ocena polimorfizmu genetycznego patogenów.
  • Poszukiwanie źródeł odporności roślin na choroby powodowane przez grzyby.
  • Mikroskopowa i molekularna detekcja zarodników workowych i konidialnych grzybów chorobotwórczych i saprotroficznych w powietrzu.

Metody

  • identyfikacja chorób roślin uprawnych na podstawie objawów makroskopowych;
  • izolacja i hodowla grzybów chorobotwórczych na podłożach mikrobiologicznych;
  • doświadczalnictwo w warunkach polowych oraz biotesty w szklarni i w komorach klimatycznych z zastosowaniem technik inokulacyjnych;
  • analiza mikroskopowa;
  • ocena grup zgodności grzybniowej (MCG), identyfikacja genów awirulencji i typów kojarzeniowych;
  • klasyczna i molekularna detekcja aeroplanktonu metodami aerobiologicznymi;
  • izolacja genomowego DNA, projektowanie starterów, reakcje PCR, Real-time PCR;
  • zastosowanie markerów molekularnych (RAPD, CAPS, ISSR, mikro- i makrosatelity);
  • sekwencjonowanie fragmentów DNA;
  • elektroforeza klasyczna i w pulsującym polu elektrycznym (PFGE).

Obecnie prowadzone prace badawcze

  • Zmienność genetyczna izolatów Ramularia collo-cygni oraz poszukiwanie odporności na ramulariozę zbóż i traw.
  • Identyfikacja źródeł odporności genetycznej na kiłę kapusty i suchą zgniliznę kapustnych u mutantów Brassica napus i mieszańców międzygatunkowych w obrębie rodzaju Brassica.
  • Opracowanie metod badawczych i prowadzenie monitoringu aerobiologiczno-molekularnego: 1) sucha zgnilizna kapustnych na rzepaku ozimym (Leptosphaeria maculans i L. biglobosa); 2) detekcja grzybów chorobotwórczych i saprotroficznych rodzaju Alternaria i Cladosporium; 3) fuzarioza kłosów pszenicy (Fusarium spp.).

Wybrane publikacje

  • Skjøth C.A., Damialis A., Belmonte J., De Linares C., Fernández-Rodríguez S., Grinn-Gofroń A., Jędryczka M., Kasprzyk I., Magya D., Myszkowska D., Oliver G., Páldy A., Pashley C.H., Rasmussen K., Satchwell J., Thibaudon M., Tormo-Molina R., Vokou D., Ziemianin M, Werner M. (2016). Alternaria spores in the air across Europe: abundance, seasonality and relationships with climate, meteorology and local environment. Aerobiologia. 32: 3-22. DOI: 10.1007/s10453-016-9426-6
  • Kasprzyk I, Kaszewski B.M., Weryszko-Chmielewska E., Nowak M., Sulborska A., Kaczmarek J., Szymańska A., Haratym W., Jedryczka M. (2016). Warm and dry weather accelerates and elongates Cladosporium spore seasons in Poland. Aerobiologia 32: 109-126
  • Perlikowski D., Wiśniewska H., Kaczmarek J., Góral T., Ochodzki P., Kwiatek M., Majka M., Augustyniak A., Kosmala A. (2016). Alterations in kernel proteome after infection with Fusarium culmorum in two triticale cultivars with contrasting resistance to Fusarium head blight. Frontiers in Plant Science 7:1217. doi: 10.3389/fpls.2016.01217
  • Kaczmarek J., Kedziora A., Brachaczek A.,Latunde-Dada A.O., Dakowska S., Karg G., Jedryczka M. (2016). Effect of climate change on sporulation of the teleomorphs of Leptosphaeria species causing stem canker of brassicas. Aerobiologia 32: 39-51
  • Błaszczyk L., Strakowska J., Chełkowski J., Gąbka-Buszek A., Kaczmarek J. (2016). Trichoderma species occurring on wood with decay symptoms in mountain forests in Central Europe: genetic and enzymatic characterization. Journal of Applied Genetics DOI: 10.1007/s13353-015-0326-1
  • Ricarova V., Kaczmarek J., Strelkov SE., Kazda J., Lueders W., Rysanek P., Manolii V., Jedryczka M. (2016). Pathotypes of Plasmodiophora brassiceae causing damage to oilseed rape in the Czech Republic and Poland. European Journal of Plant Pathology 145 (3): 559-572. DOI: 10.1007/s10658-016-0939-1
  • Dawidziuk A., Popiel D., Kaczmarek J., Strakowska J., Jedryczka M. (2016). Optimal Trichoderma strains for control of stem canker of brassicas: molecular basis of biocontrol properties and azole resistance. BioControl . DOI: 10.1007/s10526-016-9743-2
  • Niemann J., Kaczmarek J., Książczyk T., Wojciechowski A., Jedryczka M. (2016). Chinese cabbage (Brassica rapa ssp. pekinensis) – a valuable source of resistance to clubroot (Plasmodiophora brassicae). European Journal of Plant Pathology DOI: 10.1007/s10658-016-0991-x
  • Grinn-Gofroń A., Sadyś M., Kaczmarek J., Bednarz A., Pawłowska S., Jedryczka M. (2016). Back trajectory modelling and DNA-based species-specific detection methods allow tracking of fungal spore transport in air masses. Science of the Total Environment DOI: 10.1016/j.scitotenv.2016.07.034
  • Brachaczek A., Kaczmarek J., Jedryczka M. (2016). Monitoring blackleg (Leptosphaeria spp.) ascospore release timing and quantity enables optimal fungicide application to improved oilseed rape yield and seed quality. European Journal of Plant Pathology 145: 643-657. DOI: 10.1007/s10658-016-0922-x

 

Projekty badawcze

  • Nr projektu: 621321
    Tytuł projektu: BIO-TALENT The Creation of the Department of Integrative Plant Biology
    Koordynator: M. Jędryczka
    Okres realizacji: 1 lipca 2014 - 30 czerwca 2019
    www.biotalent.eu

 

  • Nr projektu: HOR hn-801-8/14 zad. 50
    Tytuł projektu: Zastosowanie konwencjonalnych i molekularnych narzędzi fitopatologicznych w poszukiwaniu źródeł odporności na kiłę kapusty oraz charakterystyka aktualnej populacji patogena w Polsce
    Kierownik: M. Jędryczka
    Typ: MRiRW Postęp biologiczny
    Okres realizacji: 1 stycznia 2014 - 31 grudnia 2020