Notice: Undefined index: alias in /home/people/clients/igrpan/igrwww/www_prod/modules/MleCMS/MleCMS.module.php on line 302

 

 

 
This is a captcha-picture. It is used to prevent mass-access by robots. (see: www.captcha.net)

Zapomniane hasło?  Zgubiony login?

Zespół Interakcji Roślina-Mikroorganizm
Na skróty

Zespół Interakcji Roślina-Mikroorganizm

Lider

dr hab. Łukasz Stępień

Skład

prof. dr hab. Jerzy Chełkowski - prof. em.
dr Lidia Błaszczyk
dr Justyna Lalak-Kańczugowska
mgr Karolina Górna (Wilman)
mgr inż. Aneta Basińska-Barczak (doktorantka)
mgr Natalia Witaszak (doktorantka)
mgr inż. Monika Urbaniak (doktorantka)

Wśród zainteresowań naukowych zespołu można wyróżnić dwa zasadnicze nurty. Jeden związany jest z patogenicznymi grzybami toksynotwórczymi (głównie z rodzaju Fusarium) infekującymi rośliny uprawne i zdolnymi do syntezy toksycznych metabolitów wtórnych - mykotoksyn. Głównym celem badań jest analiza genetycznych podstaw biosyntezy poszczególnych grup związków przez różne gatunki grzybów, a także poznanie elementów wpływających na regulację aktywności tych szlaków metabolicznych. Z drugiej zaś strony, badania koncentrują się na grzybach z rodzajów Trichoderma i Clonostachys, wykazujących właściwości mykopasożytnicze względem grzybów Fusarium. Celem tych badań jest poznanie molekularnych mechanizmów warunkujących zdolność grzybów antagonistycznych do rozkładu/ detoksyfikacji mykotoksyn fuzaryjnych oraz ich wpływu na fizjologię rośliny gospodarza.

Profil badawczy

  • Identyfikacja i charakterystyka molekularna grzybów patogenicznychwzględem roślin i owadów oraz antagonistycznych grzybów z rodzajów Trichoderma i Clonostachys.
  • Analiza toksynotwórczości grzybów Fusarium: identyfikacja genów z poszczególnych szlaków metabolicznych oraz analiza toksyn syntetyzowanych w kulturach in vitro.
  • Ocena aktywności enzymów z grupy CWDE syntetyzowanych przez grzyby pasożytnicze i antagonistyczne.
  • Analiza szybkości i intensywności biotransformacji mykotoksyn fuzaryjnych przez szczepy grzybów w hodowlach płynnych oraz identyfikacja genów i enzymów biorących udział w tych procesach.

Metody

  • izolacja grzybów z próbek środowiskowych i prowadzenie ich kultur na podłożach stałych i płynnych,
  • identyfikacja mikroskopowa gatunków grzybów patogenicznych,
  • analiza markerów  RAPD, SCAR, AFLP, SSR, klonowanie i sekwencjonowanie fragmentów DNA, analiza ekspresji wybranych genów metodą qRT-PCR,
  • analizy aktywności enzymatycznych metodami spektrofotometrycznymi,
  • identyfikacja metabolitów drugorzędowych roślin i grzybów metodami UPLC i HPLC-MS.

Obecnie prowadzone prace badawcze

  • Toksynotwórcze gatunki Fusarium – charakterystyka zmienności wewnątrz- i międzygatunkowej w obrębie klastrów genów biosyntezy mykotoksyn,
  • Grzyby Trichoderma i Clonostachys o zdolnościach do rozkładu mykotoksyn – analiza zmienności i aktywności genów kodujących poszczególne enzymy,
  • Analiza ewolucja klastra genów warunkującego biosyntezę cyklicznych peptydów przez grzyby Fusarium, Trichoderma, Beauveria i inne,
  • Metabolity pochodzenia roślinnego potencjalnie wywołujące u Fusarium proliferatum reakcje na stresy,
  • Wpływ obecności grzybów Trichoderma na fizjologię roślin pszenicy – badania na poziomie anatomicznym, metabolicznym i molekularnym.

Wybrane publikacje

Projekty badawcze

  • Nr projektu: 2015/17/B/NZ9/03577
    Tytuł projektu: Roślinne związki bioaktywne indukujące odpowiedź na stres u patogenicznego grzyba Fusarium proliferatum

    Kierownik projektu: Ł. Stępień
    Typ: OPUS
    Okres realizacji: 18 stycznia 2016 - 17 stycznia 2019
  • Nr projektu: 2014/15/B/NZ9/01544
    Tytuł projektu: Genetyczne podstawy biosyntezy cyklicznych peptydów przez patogeniczne grzyby z rzędu Hypocreales
    Kierownik projektu: Ł. Stępień
    Typ: OPUS
    Okres realizacji: 20 lipca 2015 - 19 lipca 2018