Notice: Undefined index: alias in /home/people/clients/igrpan/igrwww/www_prod/modules/MleCMS/MleCMS.module.php on line 302
Zespół Inżynierii Ściany Komórkowej Roślin
Na skróty

Zespół Inżynierii Ściany Komórkowej Roślin

Lider

dr Jorge Almiro Pinto Paiva

dr Jorge Almiro Pinto Paiva

Skład

dr Mortaza Khodaeiaminjan (postdoc)
mgr Carolina Gomes (doktorantka)


 

Profil badawczy

  • Transkrypcyjna i potranskrypcyjna regulacja biosyntezy wtórnej ściany komórkowej u roślin drzewiastych
  • Molekularne mechanizmy biosyntezy drewna oraz mechanizmy adaptacyjne u roślin drzewiastych
  • Udział sRNA oraz mechanizmów epigenetycznych w regulacji potranskrypcyjnej
  • Modulacja właściwości lignin i celulozy u roślin w celu zwiększenia ich atrakcyjności dla produkcji energii
  • Badanie bioróżnorodności upraw leśnych w celu uzyskania zrównoważonego modelu produkcji

 

Wybrane publikacje

  • Boher Pau; Soler M; Sánchez A; Hoede C; Noirot C; Paiva JAP; Serra O; Figueras M (2017) "Which genes make phellem a cork? A comparative transcriptomic approach to understanding the formation of cork". Plant Molecular Biology (PLAN)- https://doi.org/10.1007/s11103-017-0682-9

  • Leroy T, Roux C, Villate L, Bodénès C, Romiguier J, Paiva JA, Dossat C, Aury JM, Plomion C, Kremer A. (2017) Extensive recent secondary contacts between four European white oak species. New Phytol. 2017 Apr;214(2):865-878. doi: 10.1111/nph.14413. Epub 2017 Jan 13.

  • Ribeiro T, Barrela RM, Bergès H, Marques C, Loureiro J, Morais-Cecílio L., Paiva JAP (2016). Advancing Eucalyptus Genomics: Cytogenomics Reveals Conservation of Eucalyptus Genomes. Front. Plant Sci., 22 April 2016 , http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2016.00510 (*corresponding authors)

  • Kazana, V., Tsourgiannis L. Iakovoglou V., Stamatiou C., Alexandrov A., Araújo S., Bogdan S., Bozic G., Brus R., Bossinger G., Boutsimea A., Celepirovic N., Cvrcková H., Fladung M., Ivankovic M., Kazaklis A., Koutsona P., Luthar Z., Máchová P., Malá J, Mara K, Mataruga M, Moravcikova J, Paffetti D, Paiva JAP, Raptis D, Sanchez X, Sharry S, Salaj T, Šijacic-Nikolic M., Tel-Zur N, Tsvetkov I, Vettori C, Vidal N. .2016. "Public attitudes towards the use of transgenic forest trees: a cross-country pilot survey." iForest - Biogeosciences and Forestry 9: pp. 344-353. doi: 10.3832/ifor1441-008  [all authors, but 1st were positioned by alphabetic-order]

  • Yu H, Soler M, Clemente HS, Mila I, Paiva JAP, Myburg AA, Bouzayen M, Grima-Pettenati J, Cassan-Wang H.2015.Comprehensive Genome-wide Analysis of the Aux/IAA Gen e Family in Eucalyptus: Evidence for the Role of EgrIAA4 in Wood Formation. Plant Cell Physiol. 2015 Apr;56(4):700-14. doi: 10.1093/pcp/pcu215. Epub 2015 Jan 9.

  • Soler M, Camargo, Oliveira ELO, Carocha V, Cassan-Wang H, Savelli B, Hefer CA, Paiva JAP, Alexander AM, Grima-Pettenati J.2014.The Eucalyptus grandis R2R3-MYB transcription factor family: evidence for woody growth-related evolution and function. New Phytol. 206(4):1364-77. doi: 10.1111/nph.13039. Epub 2014 Sep 24.

  • Carocha V, Soler M, Hefer C, Cassan-Wang H, Fevereiro P, Myburg AA, Paiva JAP and Grima-Pettenati J.Genome-wide analysis of the lignin toolbox of Eucalyptus grandis. 206(4):1297-313. doi: 10.1111/nph.13313. Epub 2015 Feb 12.

  • Carvalho A, Graça C, Carocha, V, Pêra S, Lousada J, Lima-Brito J, Paiva JAP. 2015. An improved total RNA isolation from secondary tissues of woody species for coding and non coding gene expression analyses. Wood Science and Technology 49:647–658 DOI 10.1007/s00226-015-0709-9 [*corresponding autor]

  • Myburg AA, Grattapaglia D, Tuskan JA, Hellsten U, Hayes RD, Grimwood J, Jenkins J, Lindquist E, Tice H, Bauer D, Goodstein DM, Dubchak I, Poliakov A, Mizrachi E, Kullan ARK, Hussey SG, Pinard D, van der Merwe K, Singh P, van Jaarsveld I, Silva-Junior OB, Togawa RC, Pappas MR., Faria DA., Sansaloni CP., Petroli CD., Yang X, Ranjan P,. Tschaplinski TJ, Ye C-Y, Li T, Sterck L, Vanneste K, Murat F, Soler M, San Clemente H, Saidi N, Cassan-Wang H, Dunand C, Hefer CA, Bornberg-Bauer E, Kersting AR, Vining K, Amarasinghe V, Ranik M, Naithani M, Elser J, Boyd AE, Liston A, Spatafora JW, Dharmwardhana P, Raja R, Sullivan C, Romanel E, Alves-Ferreira M, Külheim C, Foley W, Carocha V, Paiva J,  Kudrna D, Brommonschenkel SH, Pasquali G, Byrne M, Rigault P, Tibbits J, Antanas Spokevicius, Rebecca C. Jones, Steane DA, Vaillancourt RE, Potts BM, Joubert F, Barry K, Pappas G, Strauss S, Jaiswal P, Grima-Pettenati J, Salse J, Van de Peer Y, Rokhsar DS. & Schmutz J. (2014) The genome of Eucalyptus grandis. Nature (2014) doi:10.1038/nature13308

  • Pereira-Leal JB, Abreu IA, Alabaça CS, Almeida MA, Almeida P, Almeida T, Amorim MI, Araújo S, Azevedo H, Badia A, Batista D, Bohn A, Capote T, Carrasquinho I, Chaves I, Coelho AC, Costa MM, Costa R, Cravador A, Egas C, Faro C, Fortes AM, Fortunato AS, Gaspar MJ, Gonçalves S, Graça J, Horta M, Inácio V, Leitão LM, Lino-Neto T, Marum L, Matos J, Mendonça D, Miguel, A,Miguel CM, Morais-Cecílio L., Neves I,Nóbrega F,Oliveira MM, Oliveira R, Pais MS, Paiva JAP, Paulo OS, Pinheiro M, Raimundo JAP, Ramalho JC, Ribeiro AI, Ribeiro T, Rocheta M, Rodrigues AI, Rodrigues JC,Saibo NJM, Santos TE, Santos SM, Sá-Pereira P,Sebastiana M, Simões F, Sobral RS, Tavares R, Teixeira R, Varela C, Veloso MM Mand Ricardo CPP (2014) A comprehensive assessment of the transcriptome of cork oak (Quercus suber) through EST sequencing. BMC Genomics 2014, 15:371 doi:10.1186/1471-2164-15-371 [all authors, but 1st and last one, were positioned by alphabetic-order]

  • Yu H, Soler M, Mila I, San Clemente H, Savelli B, Dunand C, Paiva JAP, Myburg AA, Bouzayen M, Grima-Pettenati J, Cassan-Wang H. 2014. Genome-wide characterization and expression profiling of the AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF) gene family in Eucalyptus grandis. PLoS One. 2014 Sep 30;9(9):e108906. doi: 10.1371/journal.pone.0108906. eCollection 2014. (IF=3.534).

 

Projekty badawcze

  • Nr projektu: 2015/18/E/NZ2/00694
Tytuł projektu: PurpleWalls - zintegrowane badania nad (de) regulacją ekspresji genomu w procesie biosyntezy drewna u wierzby purpurowej (Salix purpurea L.)
Kierownik projektu: J. Paiva
Typ: SONATA BIS
Okres realizacji: 11 maja 2016 - 10 maja 2019
 
  • Numer projektu: PTDC/AGR-FOR/0931/2014
Tytuł projektu: An Integrative Biology approach to study the molecular basis of inbreeding depression in Eucalyptus globulus.
Kierownik projektu: J. Paiva
Typ: projekt ego SELF
Okres realizacji: 2016 - 2019